2. Wake up, Neo(-sex chromosome)…
Summary
性染色体遺伝子量補償のメカニズムを2つ持ち合わせたチョウの論文を紹介しました。
Starring
イシ、エビ
Show notes
- Monarch butterfly: 和名オオカバマダラ。北米ーメキシコ間の渡りで有名。自然保護活動の一環で人工繁殖などもされているが、captivityで育ったmonarchが渡りをしなくなるという報告もある (Tenger-Trolander et al., 2019, Contemporary loss of migration in monarch butterflies)。
- Gu et al., 2019, Dichotomy of Dosage Compensation along the Neo Z Chromosome of the Monarch Butterfly: 今回紹介した論文。オープンアクセス。グラフィカルアブストラクトだけで全てわかって素晴らしい。
- James Walters lab
- Bachtrog, 2006, A dynamic view of sex chromosome evolution: 今回イントロで使った性染色体の進化に関するレビュー。オープンアクセスではない。
- Wright et at., 2016, How to make a sex chromosome: 今回のイントロの内容に対応するオープンアクセスのレビュー。
- Nei, 1969, Linkage modification and sex difference in recombination: 根井正利の性染色体進化の論文の１つ。
- Ohno, 1967, Sex chromosome and sex-linked genes: 大野乾の性染色体進化の本。
- Natri et at., 2013, Progressive Recombination Suppression and Differentiation in Recently Evolved Neo-sex Chromosomes: トゲウオのネオ性染色体でrecombination suppressionがどう進んだかをみた論文。オープンアクセス。本エピソードで赤とか青とか言っていたのはFig7。
- Lahn et al., 1999, Four evolutionary strata on the human X chromosome: 性染色体のevolutionary strataを報告した論文。
- Sex chromosome dosage compensation: 英語のWikipediaのほうが日本語より充実している…
- 訂正: 25:25 Partial compensationに関して「X染色体と常染色体の(発現の)比率はメスでは崩れている」と言っているがオスでも崩れている。
- New England Biolabs: Monarchとは明らかに羽の模様違いますよね…?
- Circos plots: イシが嫌いななんでも丸く配置するプロットの例。イシはsyntenyやhomologyのリンクを図示するとき以外には使わないがManhattan plotなどでも使う人が最近多いし、そうやって作った情報過多の図がジャーナルのカバーを飾ったりしている…。Aestheticに訴えるものがあるのは理解できるが…
- 「性決定の様式」: Bachtrog et al., Sex Determination: Why So Many Ways of Doing It?やResearchat.fm エピソード48などを参照してください。
- 「前回あたりにやった多細胞性の獲得」: エビが2021年3月27日に紹介した論文。エビが前回まで単細胞だったという意味ではない。近日公開。
- Kitano et al., 2009, A role for a neo-sex chromosome in stickleback speciation: トゲウオでネオ性染色体が行動を介して種分化に貢献していることを示した論文。
- Zhou et al., 2021, Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution: Vertebrate Genomes Projectの一環ででた単孔類(カモノハシとハリモグラ)のゲノム論文。
Editorial notes
- 指示語だけに頼るのを減らしたいです(イシ)
- しょうもないダジャレを言うようになって加齢を実感(エビ)
- 収録日: 2021.05.01
- 編集: イシ